In Muntii Apuseni vegetatie este etajata pe verticala, de la goluri alpine, la paduri de rasinoase si foioase care alterneaza cu fanete in care predomina gramineele.
In locurile pietroase por fi vazute tufe de ienupar, smardar, scorus, colilia, negara, paiusul, pelinita, afine si coacaze de munte, licheni roz, galbui-aurii sau albiciosi.
In padurile de rasinoase ale Muntilor Apuseni predomina molidul si pinul iar cea mai spectaculoasa deasa si batrana padure de molizi si pini se gaseste pe platorul carstic de la Sclavul Ples din Muntii Padurea Craiului.
In padurile de foioase ale Muntilor Apuseni se pot intalmi fagul, carpenul, frasinul, paltinul, artarul, sangerul, teiul, razlet gorunul, tisa si castanul salbatic.
Vegetatia ierboasa a Muntilor Apuseni este caracterizata de floarea pastilor, leurda, brebenei, vinarita, silnic, soparlita, macrisul iepurelui, lopateaua, margareta, sabiuta, bujorul salbatic, ochiul boului, piciorul cocosului, degetarul, fragul si ghimpele (Ruscus aculeatus)-specie ocrotita in zona Moneasa.
In poienile din zonele carstice se pot intalni palcuri de arbusti de alun, corn, porumbar cu ghimpi, zmeurisuri, mure, paducel si maces.
In zona izvoarelor, a vailor si locurile mlastinoase se intalnesc floarea de nu-ma-uita, broasca apei, bumbacarita, brustur si coada calului, salcia, rachita, arinul si plopul.
Ciupercile intalnite sunt: galbiori, urechiuse, manatarci, cineciori si ciuperci de balegar.